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片段分析

  技术原理

  片段分析(Fragment analysis,FA)是以DNA或者cDNA为模板,由PCR过程所产生的,数目不等的核苷酸构成的大小不等的DNA片段,对这些片段,利用其大小或者标记荧光的差异,进行分析的方法。被广泛的应用于医学、环境、农业研究等领域的基因型分型、DNA指纹分析、突变检测等。

  片段分析 vs 测序

  测序-检测DNA片段中的连续碱基序列

 

 

  片段分析-分离荧光标记的不连续片段并检测其相对大小

 

 

  技术平台

 

 

  分析流程

 

 

  应用范围

  • 微卫星/STR:法医鉴定、嵌合体研究、不稳定性

  • 相对荧光定量: LOH,MLPA

  • SNP分型:SNaPshot

  样本要求

 

样本类型

具体要求

冷冻组织

获得新鲜的组织样本后,立即置于液氮中快速冷冻。液氮冷冻半小时后,保存于-80°C冰箱,干冰运输。

石蜡包埋组织

每个样本需要8~10片石蜡片,每片厚4-5 μm。请提供HE染片。常温保存,常温运输。

细胞沉淀

收获培养的细胞后,离心去除培养液,PBS洗2次,立即置液氮中快速冷冻。液氮冷冻半小时后,保存于-80°C冰箱,干冰运输。

外周血

抗凝剂:可用枸橼酸钠或EDTA,不建议用肝素。外周血总量:≥2 mL。样本直接保存于-80°C 冰箱,干冰运输。

基因组DNA

TE溶解;提供Nano Drop结果;总量≥2 μg DNA (提取自新鲜及冻存样本),总量≥3 μg DNA (提取自FFPE样本);纯度OD260/280在1.7-1.9之间;浓度≥20 ng/μL。DNA完整无降解,无RNA、蛋白质等污染。

 

  检测周期

  7个工作日